تجزیه و تحلیل دادههای RNA-seq: همراه با لوح فشرده آموزش گام به گام
- نویسنده: علیرضا سیفی، محمدرضا رضایی
- تاریخ انتشار: 1400
- قیمت (ریال): 320000
- ویراستار: امین میرشمسی کاخکی
- شابک - ISBN: 978-964-386-483-5
- ناشر: دانشگاه فردوسی مشهد
- شمارگان - تیراژ: 200
- نوبت چاپ: 1
- تعداد صفحات: 128
- فروست انتشارات: 790
- قطع: وزیری
- نوع جلد: شومیز
- اطلاعات بیشتر:
-
درحالحاضر تجزیهوتحلیل دادههای RNA-seq یکی از کارآمدترین و پرکاربردترین روشهای مطالعۀ جامع پدیدههای زیستی است. معمولاً در مراکز پژوهشی در دنیا متخصّصان بیوانفورماتیک در کنار متخصّصان علوم زیستی حضور دارند و وظیفۀ تجزیهوتحلیل چنین دادههایی را عهدهدار هستند. در ایران بهندرت تشکیل چنین تیمهای تخصّصی شکل میگیرد و در بیشتر موارد پژوهشگران علوم زیستی مجبور هستند تجزیهوتحلیل دادههای RNA-seq را نیز خود انجام دهند. فراگیری ابزارهای موردنیاز برای انجام این تجزیهوتحلیلها برای پژوهشگران علوم زیستی که به اطلاعات کامپیوتری نیاز ندارند، معمولاً چالش بزرگی است. کتاب حاضر تلاشی است برای پاسخگویی به این نیاز متخصّصان علوم زیستی در کشور. بخشی از کتاب درمورد اصول کامپیوتر، مباحث نظری RNA-seq و ابزارهای موردنیاز در تجزیهوتحلیلهای بیوانفورماتیک است. بخش مهمتر آن فراهم آوردن یک مجموعۀ خودآموز RNA-seq است که با استفاده از آن خواننده قادر است به روشهای متعارف تجزیهوتحلیل دادههای RNA-seq اشراف نسبی پیدا کند و بتواند دادههای واقعی خود را با استفاده از همین ابزارها و یا حتّی ابزارهای جدیدتری که درحال ارائه هستند، انجام دهد. یک لوح فشرده شامل نرمافزارها، دادههای تمرینی و خروجیهای مراحل مختلف تجزیهوتحلیل نیز تهیه شده است و همراه کتاب در اختیار خوانندگان قرار میگیرد.
-
فصل 1. تاریخچۀ پیشرفتها در ژنتیک، بیولوژی مولکولی و بیوانفورماتیک
فصل 2. آشنایی با اصول کامپیوتر برای پژوهشگران علوم زیستی
فصل 3. سیستمعامل لینوکس
فصل 4. محیط نرمافزاری و زبان برنامهنویسی R
فصل 5. RNA-seq: انقلابی در مطالعۀ ترنسکریپتوم
فصل 6. ارزیابی کیفیت و پردازش دادههای ایلومینا
فصل 7. همردیفکردن خوانشها با توالی مرجع
فصل 8. آنالیز بیان ژنها
فصل 9. ملاحظات آماری در تجزیهوتحلیل آزمایشات RNA-seq
-
آر. ان. ا. ، نوکلوئیدها -- توالی