درباره کتاب:
درحال‌حاضر تجزیه‌وتحلیل داده‌های RNA-seq یکی از کارآمدترین و پرکاربردترین روش‌های مطالعۀ جامع پدیده‌های زیستی است. معمولاً در مراکز پژوهشی در دنیا متخصّصان بیوانفورماتیک در کنار متخصّصان علوم زیستی حضور دارند و وظیفۀ تجزیه‌وتحلیل چنین داده‌هایی را عهده‌دار هستند. در ایران به‌ندرت تشکیل چنین تیم‌های تخصّصی شکل می‌گیرد و در بیشتر موارد پژوهشگران علوم زیستی مجبور هستند تجزیه‌وتحلیل داده‌های RNA-seq را نیز خود انجام دهند. فراگیری ابزارهای موردنیاز برای انجام این تجزیه‌وتحلیل‌ها برای پژوهشگران علوم زیستی که به اطلاعات کامپیوتری نیاز ندارند، معمولاً چالش بزرگی است. کتاب حاضر تلاشی است برای پاسخ‌گویی به این نیاز متخصّصان علوم زیستی در کشور. بخشی از کتاب درمورد اصول کامپیوتر، مباحث نظری RNA-seq و ابزارهای موردنیاز در تجزیه‌وتحلیل‌های بیوانفورماتیک است. بخش مهم‌تر آن فراهم آوردن یک مجموعۀ خودآموز RNA-seq است که با استفاده از آن خواننده قادر است به روش‌های متعارف تجزیه‌وتحلیل داده‌های RNA-seq اشراف نسبی پیدا کند و بتواند تجزیه‌وتحلیل داده‌های واقعی خود را با استفاده از همین ابزارها و یا حتّی ابزارهای جدیدتری که درحال ارائه هستند، انجام دهد. لینک دریافت کلیۀ نرم‌افزارها، داده‌های تمرینی و خروجی‌های مراحل مختلف تجزیه‌وتحلیل در پروفایل کتاب در سایت انتشارات دانشگاه فردوسی مشهد به نشانی press.um.ac.ir قرار داده شده است.

فهرست مطالب:

فصل 1. تاریخچۀ پیشرفت‎‌ها در ژنتیک، بیولوژی مولکولی و بیوانفورماتیک
فصل 2. آشنایی با اصول کامپیوتر برای پژوهشگران علوم زیستی
فصل 3. سیستم‎ عامل لینوکس
فصل 4. محیط نرم‌‎افزاری و زبان برنامه‌‎نویسی R
فصل 5. RNA-seq: انقلابی در مطالعۀ ترنسکریپتوم
فصل 6. ارزیابی کیفیت و پردازش داده ‎های ایلومینا
فصل 7. هم‎‌ردیف کردن خوانش‎‌ها با توالی مرجع
فصل 8. آنالیز بیان ژن‌‎ها
فصل 9. ملاحظات آماری در تجزیه‌‎وتحلیل آزمایشات RNA-seq

موضوع:

آر. ان. ا.

نوکلوئیدها -- توالی

تقدیر نامه ها:
تقدیرنامه‌ها در دسترس نیست